Variation at HLA-DRB1 is associated with resistance to enteric fever

http://repository.vnu.edu.vn/handle/VNU_123/29569

Enteric fever affects more than 25 million people annually and results from systemic infection with Salmonella enterica serovar Typhi or Paratyphi pathovars A, B or C 1. 

 We conducted a genome-wide association study of 432 individuals with blood culture-confirmed enteric fever and 2,011 controls from Vietnam. 
We observed strong association at rs7765379 (odds ratio (OR) for the minor allele = 0.18, P = 4.5 × 10 â '10), a marker mapping to the HLA class II region, in proximity to HLA-DQB1 and HLA-DRB1.
 We replicated this association in 595 enteric fever cases and 386 controls from Nepal and also in a second independent collection of 151 cases and 668 controls from Vietnam. 
Imputation-based fine-mapping across the extended MHC region showed that the classical HLA-DRB1∗04:05 allele (OR = 0.14, P = 2.60 × 10 â '11) could entirely explain the association at rs7765379, thus implicating HLA-DRB1 as a major contributor to resistance against enteric fever, presumably through antigen presentation
Title: Variation at HLA-DRB1 is associated with resistance to enteric fever
Authors: Dunstan, Sarah J
Sarah J, Nguyen Thi
Han, Buhm
Li, Zheng
Keywords: HLA DPB1 antigen
HLA DQA1 antigen
biological marker
genetic marker
Issue Date: 2014
Publisher: Nature Genetics
Citation: Scopus
Abstract: Enteric fever affects more than 25 million people annually and results from systemic infection with Salmonella enterica serovar Typhi or Paratyphi pathovars A, B or C 1. We conducted a genome-wide association study of 432 individuals with blood culture-confirmed enteric fever and 2,011 controls from Vietnam. We observed strong association at rs7765379 (odds ratio (OR) for the minor allele = 0.18, P = 4.5 × 10 â '10), a marker mapping to the HLA class II region, in proximity to HLA-DQB1 and HLA-DRB1. We replicated this association in 595 enteric fever cases and 386 controls from Nepal and also in a second independent collection of 151 cases and 668 controls from Vietnam. Imputation-based fine-mapping across the extended MHC region showed that the classical HLA-DRB1∗04:05 allele (OR = 0.14, P = 2.60 × 10 â '11) could entirely explain the association at rs7765379, thus implicating HLA-DRB1 as a major contributor to resistance against enteric fever, presumably through antigen presentation
Description: Nature Genetics Volume 46, Issue 12, 11 December 2014, Pages 1333-1336
Nature Genetics
URI: http://repository.vnu.edu.vn/handle/VNU_123/29569
ISSN: 10614036
Appears in Collections:Bài báo của ĐHQGHN trong Scopus

Nhận xét

Đăng nhận xét

Bài đăng phổ biến từ blog này

Định tuổi tương đối của đá

Hình ảnh
  http://repository.vnu.edu.vn/handle/VNU_123/18623 Định tuổi của đá là một nhiệm vụ quan trọng trong công tác địa chất. Định tuổi của các thể đá trầm tích và magma giúp làm sáng tỏ cấu trúc địa chất của một vùng, một khu vực, đồng thời qua đó nhà địa chất có thể hiểu được lịch sử phát triển địa chất của vùng, của khu vực được nghiên cứu.  Có 2 cách định tuổi đá là định tuổi tương đối và định tuổi tuyệt đối. Định tuổi tuyệt đối của đá là xác định tuổi của các thể đá theo độ dài thời gian đã hình thành nên thể đá đó. Phương pháp xác định tuổi tuyệt đối của đá chỉ mới ra đời từ đầu thế kỷ 20, khi khoa học phát hiện đặc tính phân rã của các nguyên tố phóng xạ chứa trong đá (x. Tuổi tuyệt đối). Trong Địa chất học việc định tuổi tương đối của đá đã được chú ý từ thế kỷ 17, khi các nhà địa chất chú ý nghiên cứu địa tầng học. Đó là xác định mối quan hệ già trẻ của của các thể đá với nhau trong một mặt cắt địa chất, một vùng hoặc một khu vực mà không tính độ dài thời g...
Đọc thêm

Multifunctional drug nanosystems: A summary of recent researches at IMS/VAST

Hình ảnh
  http://repository.vnu.edu.vn/handle/VNU_123/34071   The main task of nanomedicine is to fabricate, normally by chemical engineering, nanoscale systems that can play various functions of both diagnosis and treatment.  This report aims to present some researches, carried out by the Laboratory of Biomedical Nanomaterials (IMS/VAST in Hanoi), on fabrication and characterization of nanovectors for the disease of cancer. The first part deals with magnetite (Fe3O4) nanoparticles (MNPs) based nanoconjugates, functionalized by coating with several polymers as well as loaded with a drug of curcumin. The used MNPs were obtained by coprecipitation, exhibited spherical shape of diameter of 15-20 nm, saturation magnetization of Ms ~ 65-70 emu/g. The coating polymers were acrylic acid (PAA), chitosan (CS) and Alginate (Alg) which were confirmed using the infrared (FTIR) spectra. Magnetic Inductive Heating (MIH) measurements demonstrated that the fabricated MNPs-based...
Đọc thêm

Đình ngự triều Di Quy (Cổ Loa - Hà Nội)

Hình ảnh
Mời các bạn tìm hiểu luận văn “Đình ngự triều Di Quy (Cổ Loa - Hà Nội)” của tác giả Trịnh Ngọc Huân tại đường link http://repository.vnu.edu.vn/handle/VNU_123/33874 Đình Ngự Triều Di Quy, dựng trên nền điện thiết triều cũ, năm 1907, thời Nguyễn. Hình dáng bề thế, mái đao vút cong Cột đình còn đôi câu đối của Tôn Thất Thuyết. Hội đình tổ chức vào đầu xuân hàng năm. Dân gian có câu: “Chết bỏ on cháu, sống không bỏ mồng sáu tháng giêng”. Luận văn là chuyên khảo đầu tiên về đình Ngự Triều Di Quy. - Giới thiệu, phân tích vị trí cảnh quan, môi trường đình Ngự Triều Di Quy. - Hệ thống hóa, miêu tả di tích đình Ngự Triều Di Quy trên các phương diện mặt bằng, kiến trúc, vật liệu xây dựng, kỹ thuật xây dựng, điêu khắc trang trí. - Xác định các đặc trưng kiến trúc, điêu khắc trang trí của đình Ngự Triều Di Quy trên cơ sở so sánh với một số di tích đình làng trong khu vực và ở nơi được cho là gốc tích của đình Ngự Triều Di Quy. - Trên cơ sở thực trạng của di tích đề ...
Đọc thêm